В течение многих лет, Chlamydophila psittaci выделяли только одними методами: при помощи выращенных клеточных культур на куриных эмбрионах куда сеяли материал из полученных путем соскабливания бактериальных клеток , в месте локализации инфекции пациентов. Затем визуализировали возбудитель путем световой и люминисцентной микроскопии. При помощи другого метода идущего обычно параллельно выделению клеточных культур выявляли наличие специфических антител в сыворотке крови больных и переболевших животных . Принимая во внимание повышенную опасность выделения клеточных культур такие лабораторные работы требуют от лабораторий сильную биологическую защиту, что накладывает определенные затруднения в оперативности и быстроте получения результатов исследования. По наставлению по лабораторной диагностике орнитоза ( хламидиоза) птиц от 26.04.99 года № 13-7-2/1573 указывается, что « работа с возбудителем хламидиоза птиц допускается в лабораториях, имеющих условия для работы с особо опасными инфекциями и разрешение СЭС на работу с возбудителями 1-2 групп; исследования на хламидиоз проводят в отдельном боксе или отдельной комнате с настольным боксом». Патологический материал который может представлять из себя помет, соскобы с конъюктивы и клоаки, взятых от живых птиц количеством не менее трех образцов во временном промежутке 5 дней ( в связи с непостоянным выделением птицей ЭТ хламидий) отправляется в лабораторию для исследований. От павших или птиц подвергшихся эвтаназии ( не позднее 2 часов после смерти) берется патологический материал состоящий из кусочков печени, селезенки и экссудата брюшной полости). Полученный материал помещают в стерильные пробирки или флаконы с резиновыми пробками, а затем помещают из в термос со льдом. Павших птиц также можно отправить в лабораторию целиком, для этого трупы заворачиваются в несколько слоев марли или ткани, которую смачивают 5%-ным раствором хлорамина, помещают во влагопроницаемую тару ( можно в несколько полиэтиленовых пакетах). Затем материал опечатывают и доставляют в лабораторию не позднее 24 часов после взятия. В лаборатории вскрытие подозрительных на хламидиоз птиц проводят в отдельном боксе, согласно требованиям за № 13-7-2/1573.
Для проведения серологического исследования забирают пробы крови у птиц на 5-12 день заболевания, центрифугируют и полученную сыворотку к в количестве 1-2 куб см посылают в лабораторию. Отобранную сыворотку хранят при температуре 18-20 С ниже нуля, и исследую одномоментно. Двухкратное размораживание сыворотки не допускается. Сыворотка собирается в стерильную посуду. Специфические антитела к хламидиям
птиц, определяется в реакции связывания комплемента (РСК), или реакции непрямого связывания комплемента (РНСК) или иммуноферментным анализом (ИФА). Есть отличия в определении антител у РНСК, заключающиеся в том, что РНСК выявляет "неполные" антитела, образующиеся в крови некоторых видов птиц.
Более современным и, ведущим направлением в исследовании хламидиоза является молекулярно-биологические методы индикации и идентификации хламидий – ПЦР. В который входят и анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов (ПДРФ), и секвенирование ДНК. Методы ПЦР обладает высокой чувствительностью и специфичностью. Возможно одновременно исследовать большое число проб. Согласно требованиям за № 13-7-2/1573 для работы ПЦР лаборатории используется предварительно инактивированный материал прогретый при 70-80С в течение 10 минут, или залитым 0,5% раствором фенола или гуанидин тиоционатом в концентрации 5,3 моль/л.